Package index • KGExplorer

All functions
`add_`	Add functions
`add_ancestors()`	Add ancestors
`add_db()`	Add database
`add_hoverboxes()`	Add hoverboxes
`add_ontology_metadata()`	Add ontology metadata
`cache_clear()` `cache_dir()` `cache_files()` `cache_save()`	Cache functions
`get_alphamissense()` `get_clinvar()` `get_data_package()` `get_definitions()` `get_gencc()` `get_gene_lengths()` `get_genes_disease()` `get_graph_colnames()` `get_medgen_maps()` `get_metadata_omim()` `get_metadata_orphanet()` `get_monarch()` `get_monarch_files()` `get_monarch_kg()` `get_monarch_models()` `get_mondo_maps()` `get_mondo_maps_files()` `get_ols_options()` `get_ontology()` `get_ontology_dict()` `get_ontology_levels()` `get_pli()` `get_prevalence()` `get_ttd()` `get_upheno()` `get_version()`	Get functions
`get_ontology_descendants()`	Get ontology descendants
`get_opentargets()`	Get Open Targets
`graph_to_plotly()`	igraph to plotly data
`kde_surface()`	Kernel Density Estimation (KDE) surface
`link_monarch()`	Link functions
`main_`	Main functions
`map_colors()` `map_genes_monarch()` `map_medgen()` `map_mondo()` `map_ontology_terms()` `map_upheno()` `map_variants()`	Map functions
`map_genes_dt()`	Standardise genes
`map_upheno_data()`	Map uPheno data
`plot_graph_visnetwork()`	Plot graph using visNetwork.
`plot_upheno()`	Map uPheno plot
`prune_ancestors()`	Prune ancestor
`query_oard()`	Query functions
`query_phenoscape()`	Query Phenoscape
`query_ubergraph()`	Query ubergraph
`set_cores()`	Set cores
`unlist_dt()`	Unlist a data.table

Reference